日喀则是西藏交通中心，境内公路比较发达，拥有318国道、日（喀则）亚（东）公路、拉（萨）普（兰）公路、中尼公路贯通东西南北。由新路前往日喀则距离250公里。

随着2013年之后本土航空公司西藏航空的加入，日喀则机场航班进一步加密，日喀则航线网络也得到进一步拓展，当地航空航线运力得以增强，进出日喀则的出行时间、选乘航空公司也日趋多元化。

日喀则和平机场：日喀则地区有一个机场，即日喀则和平机场。该机场位于西藏日喀则地区江当乡境内，距离日喀则市区43公里。 2010年10月30日正式通航。 日喀则机场是继拉萨贡嘎机场、昌都邦达机场、林芝米林机场和阿里昆莎机场之后的西藏第五个民用机场。目前日喀则机场开通了国内往返成都双流机场的航线，一周内仅有个别天数（如周二、周六）设有班次。

地址：日喀则地区日喀则市桑珠孜区江当乡境内318国道旁

电话：0892-8821070

作为青藏铁路延伸线的拉日铁路，以拉萨与日喀则为节点，连接两地，全长253公里，用时约3小时，硬座40.5元，已于2014年8月15日开通客运，这将极大促进日喀则的发展，并方便拉、日两市的交通便利。

日喀则火车站：日喀则火车站为已通车的拉日铁路终端，距离拉萨站253公里，隶属青藏铁路管辖。现为二等站，未来这里还将是日喀则-亚东铁路的起点。该站于2014年8月15日正式开通运营，每日有两班列车进出站，K9821次列出早上9:00从拉萨发车，12:00到达日喀则，K9822次列车17:30从日喀则发车，20:27到达拉萨。

地址：日喀则地区日喀则市甲措雄乡占堆村

日喀则地区境内公路四通八达，318国道、日亚公路（日喀则－亚东）、拉普（拉萨－普兰）公路、中尼公路（中国－印尼）贯通东西南北。拉萨至日喀则班车在拉萨西郊汽车站（靠近拉萨河畔的青藏川藏公路纪念碑）上车，车型是宇通中巴，一路基本是平坦的柏油公路，全程约4小时，票价为50元。日喀则至拉萨，则在日喀则客运站（日喀则安康客运旅馆对面）上车，票价、耗时相同。
日喀则东郊客运中心：由日喀则开往各地的公营长途汽车比拉萨所发车辆少，只开往拉萨及萨迦的有定期班次前往，亚东每日或隔日上午均有长途汽车前往，班次及时间视乘客人数而定。
地址：日喀则地区日喀则市青岛路与仁布路交汇处

前往日喀则地区，包车是大多数旅客首选的交通方式。从拉萨包车前往，约260公里，一般包车约1200元左右，包车4-5天则约2500-3000元。参考价格为：普通型越野车，如丰田4500，根据淡旺季，大约3.5元-5元/每公里；豪华型越野车5元-7元/每公里。