新竹市现没有机场，原有的新竹机场已停运，但可以从台湾桃园国际机场、台北松山机场出发前往新竹。此外，新竹有高铁、台铁，国道中山高速公路、福尔摩沙高速公路以及多条省道，来往很方便。
新竹机场现已经停止民航。但地方近年则有希望重启新竹机场民航服务的呼声，以提供新竹居民与竹科厂商飞行两岸与区域国际航线的客货运服务。与此同时，游客可以从台湾桃园国际机场、台北松山机场出发前往新竹。具体方法为：
1、桃园国际机场 - 新竹市
（1）在机场乘坐高铁接驳巴士（免费）到台湾高铁，然后买票到新竹，高铁到新竹自由席票价(不指定座位)约90元，桃园到新竹 约14分钟。
（2）可搭乘统联汽车客运公司（台湾桃园国际机场至新竹清华大学站），或搭乘桃园客运至桃园火车站转搭火车到新竹。第一航厦及第二航厦入境大厅旁，均有客运公司柜台。
第一航厦一楼入境柜檯：+886-03-3834779
第二航厦一楼入境柜檯：+886-03-3833551
（3）直接乘坐出租车到达新竹，费用约1,600元台币
2、台北松山机场 - 新竹市
（1）从台湾松山机场搭文湖线捷运到忠孝复兴站即有往新竹市区的班车，或在忠孝复兴站转蓝线到台北车站,換搭台铁列车或客运前往新竹。
（2）如果是前往新竹县可直接搭豪泰客运(松山机场-新竹)。
桃园国际机场：台北桃园国际机场，原称中正国际机场、中正国际航空站，位于台湾桃园县大园乡，是台北市的主机场与北台湾主要的货运以及旅客出入吞吐，也是台湾地区境内最大最繁忙的机场。
地址：桃园市桃园县大园乡航站南路9号
电话：+886-03-3983728
网址：http://www.taoyuan-airport.com/
台北松山机场：台北松山机场是一座位于台湾台北市松山区的中型机场，别称松山机场、台北机场，为一军民合用机场。
地址：台北市松山区敦化北路
电话：+886-02-87703460
纵贯线铁路贯穿新竹市，境内设有新竹及香山两站，其中新竹站各级列车多有停靠，班次密集。
高铁
新竹车站：新竹车站位于台湾新竹县竹北市，与新竹市中心直线距离约10公里。服务范围涵盖新竹县市以及苗栗县中北部等地区。
地址：新竹市竹北市高铁七路6号（“高铁新竹车站特定区”）
电话：+886-04-0660000
Tips：透过站区北侧光明六路、站区南侧兴隆路、国道1号、国道2号、台68(东西向快速公路南寮－竹东线)、县道120、122、自强南路、慈云路重要道路交通系统，乘客可以快速转往新竹地区所有重要城镇。
营业时间 6:30-23:45，新竹—台南，71分钟；新竹—左营，98分钟；新竹—台北，32分钟。
台湾高铁官网：http://www.thsrc.com.tw/index.html?force=1
台铁
新竹火车站位于新竹市区的中心，与桃竹苗生活圈(竹科)的关系紧密距离2公里，区间的通勤多仰赖铁路运输。日治时期，纵贯铁路由新竹继续向南兴筑，并自新竹驿开辟支线西北向新竹机场、东向竹东（后来的内湾线），使新竹车站取代北门街成为新竹城市的中心，成为新竹地区的交通枢纽。配合台铁捷运化政策，内湾线竹市段全数高架化，也新增三座通勤车站：北新竹车站、千甲车站、新庄车站，以及一条高架捷运化通勤铁路：六家线。
纵贯线新竹车站（新竹火车站）：一等站，位于市区，站房为巴洛克式建筑，现已列为国定一级古迹。
地址：新竹市荣光里中华路二段445号
电话：+886-03-5237441
北新竹车站：简易站，位于市区，只停靠区间车。
地址：新竹市东园里中华路一段291之2号
香山车站：甲种简易站，位于香山区，是全台唯一以桧木兴建的木造车站。
地址：新竹市朝山里中华路五段347巷2弄27号
电话：+886-03-5307105
千甲车站：简易站，位于台湾新竹市东区，与内湾线新竹至竹中路段衔接六家线，是配合台铁捷运化政策，作为接驳台湾高铁新竹站而新设的车站之一。
地址：新竹市水源里3邻千甲路142号
新庄车站：简易站，位于东区。
地址：新竹市新庄里关东路310号
具体情况或订票信息可参照下列网站：
铁路管理局网：http://www.railway.gov.tw
铁路时刻表及票价：http://twtraffic.tra.gov.tw/twrail/
台湾铁路订票系统：http://railway.hinet.net/ （24小时可订票）
台湾西部各大城市皆有台汽客运开往新竹市。一般而言非繁忙时段的交通颇为畅顺，可以不需事先订票，而年节假期乃高速公路壅塞时段，则需事先安排或可考虑搭乘其他交通工具，以节省时间。
新竹客运为境内主要大众运输工具，可分为通往市区各地的市公车系统及往竹东、竹北、关西、龙潭、中坜、杨梅等邻近市镇的客运系统，前者总站位于民族路上的SOGO百货旁，后者总站设在火车站右侧。
新竹总站：竹总站现有二处月台，其中一处位于站内，另一处月台位于中华路上，现有站址前身为台汽新竹站。
地址：新竹市中华路二段471号
电话：+886-03-5259599
新竹客运湖口站：新竹客运湖口站坐落于本乡中山路二段，游客可由此站前往新竹县、桃园市、新竹市。
地址：新竹县湖口乡中山路二段90号
台湾长途客运网站：
新竹当地以公交车（有部分免费公车）和出租车为主要交通方式。
新竹市连接18乡镇的大众运输主要为公共汽车，市区公车由新竹客运营运，有诸多班次和路线，以新竹车站为中心往复行驶，服务学生以及老年人为主，其中以1路及15路的运输机能较发达，其他路线车次甚少。
新竹市全部路线除81路外皆由新竹客运行驶，免费公车55(区)、57(区)、90、世博馆接驳车、竹堑小巴均使用电动公车。
新竹市免费公车：
50号：香山区公所－香山区公所 (先经中华路)
51号：香山区公所－香山区公所 (先经中山路)
52号：新庄车站－市政府 (经建功路)
53号：新庄车站－市政府 (经九甲埔)
55号：南寮－竹科 (使用华德低底盘电动公车)
55区间车：南寮－新庄车站 (使用华德低底盘电动公车)
57号：竹科－城隍庙 (使用华德低底盘电动公车)
57区间车：新庄车站－城隍庙 (使用华德低底盘电动公车)
90：火车站－竹科 (使用立凯电低底盘电动公车)
竹堑小巴 (使用立凯电中型电动公车)
70号：新庄车站－金山
71号：后站－财神庙72号: 大润发2站－富群
73号：大润发2站－花园新城
75号：北区区公所－北区区公所 (经金竹里)
76号：北区区公所－北区区公所 (经经国路)
77号：香山区公所－中华大学
78号：香山区公所－树下浸水
79号：香山区公所－香山区公所 (南隘线)
80号：香山区公所－香山区公所 (南港线)
81号：新庄车站－古奇峰 (唯一一条非新竹客运营运路线，由科技之星营运)
世博馆接驳车 (使用立凯电低底盘电动公车)
世博一号：世博台湾馆－城隍庙－世博台湾馆 (先经北大路)
世博一号：世博台湾馆－城隍庙－世博台湾馆 (先经中华路)
世博二号：世博台湾馆－灵安宫
世博三号：新竹转运站－世博台湾馆－金山十八街
世博五号：世博台湾馆－香山区公所－明烈宫-圣公宫
Big City远东巨城购物中心接驳车
火车站－Big City远东巨城购物中心 (与新龙汽车联营)
大远百接驳车
火车站－大远百
计费：
起程：1250公尺/100元新台币
续程：250公尺/5元新台币
计时：3分钟/5元新台币
电话叫车：
红帅汽车行：+886-03-5713333
金立卫星汽车行：+886-03-5223333、+886-03-5221111
中华卫星（第一無線電計程車）：+886-03-5516000
新竹市现有渔港包括新竹渔港与海山渔港，无工商业货物运输，主要功能为近海渔业及观光游憩。
新竹渔港：新竹渔港前身为南寮渔港，位于台湾新竹市北区、头前溪出海口南侧的南寮，西临台湾海峡。
地址：新竹市北区南寮里南寮街