清乾隆、道光、光绪年间曾多次重修。由大殿、门厅、厢房、天井、回廊等组成，占地面积2亩多。当地人用以供奉北帝、如来、观音，是道、佛合二为一的寺观。每年农历三月初三为该寺观庙会。1944年日军入侵广西，桂林沦陷，何香凝、欧阳予倩、高士其、梁漱冥等大批爱国人士疏散到了黄姚， 1945年，以钱兴为书记的中共广西省工委迁到黄姚，设在宝珠观内，开展隐蔽的抗日斗争。为纪念这一段历史，1986年广西壮族自治区人民政府把宝珠观定为广西省工委旧址，1994年列为省级文物保护单位和爱国主义教育基地。