该博物馆是世界上较早的博物馆之一，由12个陈列馆与5个艺术长廊组成，汇集了埃及、希腊、罗马古代文物和文艺复兴时期的艺术精华，是一座藏有无价瑰宝的博物馆。馆内藏品虽然该博物馆的占地面积不大，但其堪称巨作的馆藏却不胜枚举。如米开朗琪罗创作的穹顶画《创世纪》收藏于此，十分值得一看。同时，对于爱好考古的朋友来说，馆内收藏的一些古希腊、古罗马文物同样值得研究。当然，除了里面的藏品，博物馆本身的建筑风格也很值得称道。古老的犹如城墙一般的外墙，出口处的螺旋形坡道、松果庭院内的雕塑作品《破碎的地球》，都值得大家细细品味。参观指南松果庭院进入博物馆，首先游览的就是松果庭院，这里保留了16世纪欧洲观景庭院的风格，有名的雕塑作品《破碎的地球》是雕塑家阿纳尔多﹒波莫多罗的作品。庭院北面尽头有棵高约4米的巨型青铜松果树，树的两侧有两个青铜孔雀，这是公元二世纪的复制品，原件保存在博物馆内。庭院的一侧还有西斯廷礼拜堂的壁画说明图，游览之前可以先看一下。从庭院的右侧铁门进入后就是希腊罗马雕刻艺术馆，包括基亚拉蒙蒂博物馆（Museo Chiaramonti）、比奥克莱孟博物馆（Museo Pio-Clementino）的胸像陈列室（Room of Busts）、新翼陈列室（Braccio Nuovo）。《尼罗河》是奥克莱孟博物馆内较大的雕像。这个尼罗河神群像是纪念性雕塑，揭示了希腊艺术深受埃及艺术影响的事实。庇欧•克莱蒙提诺博物馆接着来到庇欧•克莱蒙提诺博物馆（Museo Pio Clementino）的八角庭院（Cortile Ottagono），这里是有名的雕像展区，博物馆中三大镇馆之宝中的两件雕像作品就在这里，《拉奥孔》和《阿波罗》。其他如古希腊的雕像作品《海尔梅斯像》和左手拿着美杜莎的头的《柏修斯》也很有欣赏价值。经过八角庭院后就是动物馆了，其实这里差不多属于一个过道，面积不是很大，但是东西不少。展品很多都是带有戏剧化的血腥场面，可以一笔带过。庇欧•克莱蒙提诺博物馆的一个展厅是希腊十字厅（Greek Cross Room），这里重要的藏品是地板上的镶嵌画《米涅瓦》，她的希腊名字就是“雅典娜”，有名的智慧与正义战争的女神。另一个展厅是圆形的，所以也叫圆形展厅，音译为“罗通达”展厅。展厅中央的大盘很显眼，据记载是罗马皇帝尼禄（Nero）的浴盆。继续参观就来到了缪斯馆，这里的缪斯女神像神态安祥，举止优雅，简直就是古罗马美的典范。但是她们只能靠边站，因为这里还有另外一件镇馆之宝——《残躯》。希腊雕像的生命充满身体各个部分，即使只剩下断臂残躯，仍然能给人以生命力和美感。雕像放在展馆中央位置，顶部的天花板也值得留意一下。接着就到了埃及馆，全称是格里高利埃及博物馆（Museo Gregoriano Egizio）。进门口的一块石头有近5000年的历史，是公元前2700多年的。展厅内还有诸多木乃伊，虽然大英博物馆里面也有，但那里面是关着的，该博物馆里面的木乃伊的棺盖是打开的，可以直接看到木乃伊躺在棺材里面。从埃及馆出来沿楼梯向上就到了埃特鲁斯坎博物馆（Museo Gregoriano Etrusco），这里是以文物收藏家命名的一个展览厅，这些文物都是从埃特鲁斯坎文明的考古遗址Cervederi的大坟地收集来的。 二楼长廊游览参观完了埃特鲁斯坎博物馆之后就来到二楼，200米长的走廊被分成三个展区，坎代拉勃利陈列室（Galleria dei Candelabri Caridclabras）、挂毯陈列室和卡尔泰陈列室（Galleria delle Carte Geograticlle）。天花板上到处都有教皇徽章，坎代拉勃利陈列室内知名的就是雕像作品《狄安娜》。挂毯陈列室的墙壁上挂着绣有耶稣生平事迹的19幅华丽的壁毯，每张约有四到五百年的历史。由于早期没有机器编织，所以这些全都是人工按着草图一针一针织出来的。拉斐尔展室从二楼长廊里可以直接进入华丽的拉斐尔展室（Raphael's Room），这里曾是教皇尤里乌斯二世的寝宫，以拉斐尔恢弘且美轮美奂的壁画作装饰，这里由四个连贯的房间组成，其中签名室中的壁画作品《雅典学院》被认为是拉斐尔伟大的杰作之一。另外，君士坦丁室、希略多拉斯室及拉斐尔回廊中的壁画作品《波尔哥的大火》也值得一看。现代宗教美术藏品展室从拉斐尔展室出来，前往西斯廷教堂的路上会经过一个现代宗教美术藏品的展室，里面也有很多展品，内容当然离不开天主教，但是艺术风格很现代。有兴趣可以参观一下拍几张。西斯廷教堂然后就是参观整个博物馆的高潮部分——西斯廷教堂。里边拱形的天花板上有米开朗基罗的非凡巨作《创世纪》。绘画馆如果时间充裕的话，参观完教堂后还可以去位于该博物馆入口进去中庭右边的绘画馆看看。这里按年代顺序展出的有从拜占庭时代到现代的以宗教绘画为主的作品。第四展室是梅罗兹奥•达•弗路里的作品《演奏音乐的天使》。第八展室有拉斐尔的杰作《玛利亚的加冕》、《弗里良的玛利亚》、《基督的样貌变化》等不要错过。另外，还有10张拉斐尔画的草图，由布留塞尔织的壁毯。第九展室有列奥纳德•达•芬奇未完成的《圣•吉罗拉莫》、巴洛克艺术的巨匠贝尔尼尼的《基督降架》。螺旋形坡道值得一提的是，看完众多展馆的精品之后，还有一处很值得游客品味的地方，那就是博物馆出口处的螺旋形坡道，由摩莫设计建造，世界上独此一个，上面装饰有教皇们的徽章。事实上这条螺旋坡道是由两条环形坡道构成的，因为视觉上的错觉，看起来好象只有一条坡道，十分地有趣，估计是轮换开放的。从楼梯顶部朝下拍摄，这个角度的照片出现在各种媒体上。