南岳山及其景区属北亚热带温暖季风气候区，地处中纬度、大别山北麓，是亚热带向暖温带过渡的黄金地带。气候温暖湿润，雨水充沛，四季分明。南北森林交替繁生，自然形成南北兼有的常绿针阔叶混交林和常绿落叶阔叶混交林的森林植物群落。其地质岩性主要为花冈岩及片麻岩，如旗杆夹以下至青龙尖一带裸露在外的，即为典型的片麻岩。