慈云寺原名阿里山寺，建于1919年，日本人当年由于有感于此地的山水灵气，而在此地建立佛寺，这里也是观云海晚霞的好去处。寺中供奉着迦牟尼佛像，这是千年古佛，外为铜铸，内为金砂，是泰国国王于1918年赠与日本天皇的。慈云寺是阿里山观云海、晚霞、落日的地方之一，在此还可远望阿里山聚落及塔山，此处也是由慈云寺通往神本的步道，傍晚时分漫步其中，若逢落日余晖，金色的云海，浪花飞舞，美不胜收。慈云寺旁那棵高大俊硕的台湾杉亦不容错过，在台湾树木中以台湾为属名，仅台湾杉一属一种而已，是台湾的特产，弥足珍贵。