青海可可西里国家级自然保护区因海拔高、气候干旱寒冷，形成了典型的高寒气候特征。由于海拔在4600米以上，温度低，大风多。在西金乌兰湖地区有一明显的相对暖区。
夏秋季：可可西里夏季较短6-8月，天气多晴朗，气温较高，夜间常有降雨，7月的降水量是全年总量的1/3以上，这会使可可西里成为一个巨大的沼泽。气候却相对比较平稳，尤其盛夏时节气候凉爽。是天然的避暑胜地，最适宜出行。秋季更加短暂，基本与夏末重合。
冬季：冬季时间较长，9月份过后就有可能会下雪，出现暴雪天气就会封山，出行前要做好准备。
6-8月为最佳旅游时间，6月初可以看到藏羚羊迁徙的场面，每年迁徙时间会有偏差，需提前查阅。夏秋交际的时候，夜间会产生较多降雨，空气湿润，白天气温也相对温暖，气候舒适，最适宜游玩。