阿勒泰市属温带干旱气候，春季多风，夏季多雨，秋季凉爽，冬季寒冷而漫长。阿勒泰的春季较短，一直到4、5月份才算进入春天，气温回升较快，但因冷空气入侵，常有倒春寒；夏季的阿勒泰日照充足，气温舒适，6月份的喀纳斯百花盛开，一片盎然景象，7、8月份的气温则最为适合游玩；秋季的阿勒泰气温下降较快，9月也是旅游的黄金时节，喀纳斯变为金色，天高云淡，10、11月气温骤降，开始进入冰期；阿勒泰的冬季较为漫长，气候寒冷，被冰雪覆盖。
阿勒泰最佳旅游时间是夏秋季节。
夏季的阿勒泰气候凉爽，绿意盎然，湖光山色，景致正佳。
秋季的阿勒泰则是被金黄色和红色所覆盖，亦是别具意境。