洞头百岛气候宜人，属典型的亚热带海洋性季风气候，冬暖夏凉，四季皆宜。夏季，气温较温州还要低2-5摄氏度，当大陆热浪滚滚时，岛上却依然凉风习习；而洞头的冬季总是姗姗来迟。平均始于十二月下旬，冬天一般不下雪，并时有杜鹃花盛开。
洞头岛上有客运中巴，从县城北岙镇到客运码头中巴车2元，10分钟即到。从县城到妈祖庙、大沙岙等景点也有定班车前往。大门岛上从码头到马岙潭每小时有一班公交车前往。