钓鱼岛主权馆馆内展示的主要是一些图片画册。刘公岛管委会方面表示，准备将增加多媒体、影视、互动环节，也会不断增加藏品，他们也希望能收藏此前保钓人士用过的物品。馆内的“捍卫主权”展区看到，这里展出了“中国渔政依法在钓鱼岛海域实施常态化护渔巡航”、“中国海警巡航编队开始在钓鱼岛海域实施常态化维权巡航”、“中国东海舰队联合‘三军’开展海上军演”等图片，表明中国坚决捍卫领土主权和海洋权益的立场。展馆内的“钓鱼岛上空的阴霾”板块还展出了“日本海上保安厅船只撞击香港保钓船‘启丰二号’”、“日本海上保安厅干扰中国渔民正常作业”、“日本自卫队针对钓鱼岛举行夺岛军演”等许多图片，真实记录了日本不断对钓鱼岛采取的非法行动。国家海洋局方面表示，将支持威海刘公岛继续丰富、充实该馆，收藏包括保钓人士纪念物等在内的各类钓鱼岛主权相关的物品，将之建设为永久性的钓鱼岛主权馆。