上高地在古时的写法是“神垣内”，意指穗高神社（其本宫位于安云野市）所祭祀的名为“穗高见命”的神明降临在穗高岳时，会在此处被祭拜，祭拜的设施及具体地点则是这个距离大正池 6 公里以上的穗高神社及其境内的明神池。神社本身只有一个很小的建筑，但境内一大一小两个池子——明神一池和明神二池非常值得一看。由于是一处人文景点，神社收取门票，这也是整个上高地地区唯一需要门票的地方。明神一池和明神二池有着不同的风格。明神一池平静、纯洁，且较为广阔，也是每年一度的船祭（お船祭り）所举行的场所，而明神二池的水中散布着众多岩石，有一种典型日本庭园的风味。