天水南站是宝兰客运专线的重要中间站，拟建设的宝兰客运专线天水南站位于城市南侧秦州区与麦积区之间，北侧为城市主干道羲皇大道，车站总建筑面积24000多平方米，站房建筑面积12000平方米，按三站台七道设计，车站有立折能力，可办理始发终到业务。预计2016年完工。